BACTEROIDETES: GENEL ÖZELLIKLER VE SISTEMATIK - BIYOLOJI - 2025

Bakteroidler , bakterilerin sınıflandırıldığı filumlardan biridir. Bu filum, dört sınıftan (Bacteroidia, Flavobacteria, Sphingobacteria ve Cytophagia) ve Dünya üzerindeki tüm habitat türlerini kolonileştiren 7.000'den fazla farklı türden oluşur.

Toprakta, aktif çamurda, çürüyen bitki materyalinde, kompostta, okyanuslarda, tatlı suda, alglerde, süt ürünlerinde ve hastalıklı hayvanlarda bulunurlar. Ilıman, tropikal ve kutup ekosistemlerinde dağıtılır. Açık habitatlarda izole edilen bakteroidler esas olarak Flavobacteria, Cytophagia ve Sphingobacteria sınıflarına aittir.

Bacteroides termitidis. www.pixnio.com. Yazarlar: Janice Haney Carr, CDC Brian J. Beck, PhD, American Type Culture Collection, USCDCP

Bakteroidler, insan bağırsak yolunun ve diğer memeliler ve kuşların önemli bir parçasıdır. İnsanlarda, önemli bir enerji kaynağı olan konukçu tarafından yeniden emilen yan ürünleri üreten polisakkaritlerin ve karbonhidratların parçalanması yoluyla bağışıklık sisteminin aktivasyonuna ve beslenmeye müdahale ederler.

Bacteroidetes filumunun türleri, fırsatçı patojenlerden oluşan Bacteroides cinsi ve insanlar, diğer memeliler, tatlı su balıkları veya deniz balıkları için patojen olan bazı Flavobacteriaceae hariç, çoğunlukla patojenik değildir.

karakteristikleri

Bu filumda sınıflandırılan bakterilerin ortak bir evrimsel geçmişi ve geniş bir morfolojik, fizyolojik ve ekolojik çeşitliliği vardır. Kısa veya uzun, düz, iğ şeklinde veya ince filamentler olabilirler. Gram negatiftirler ve endospor oluşturmazlar.

Fakültatif anaerobik veya tamamen aerobik olabilirler. Hareketli olmayabilir, kamçılı olabilir veya kayarak hareket edebilirler.

Fermentatif metabolizmaya sahip bazı türler olmasına rağmen, bunlar kemoorganotrofik, aerobik veya solunum metabolizması ile fakültatif anaerobiktir.

Sistematik

Cytophaga-Flexibacter-Bacteroides grubu olarak da bilinen filum Bacteroidetes, dört sınıftan oluşur: 7000'den fazla farklı türü gruplayan Bacteroidia, Flavobacteria, Sphingobacteria ve Cytophagia.

Önceki sınıflandırmalarda, filum Bacteroidetes üç sınıftan (Bacteroidia, Flavobacteriia ve Sphingobacteriia) oluşuyordu. Bununla birlikte, 16S rRNA geninin sekans analizine dayanan daha yeni çalışmalar, bu filum, Cytophagia'da dördüncü bir sınıfın oluşumunu haklı çıkarmaktadır.

Bu yeni sınıfa dahil, önceden Flexibacteraceae, Flammeovirgaceae ve Crenotrichaceae aileleri içinde sınıflandırılmış birçok cins vardır. Bu nedenle, Bacteroidetes filumu, iyi tanımlanmış en az dört filogenetik grup içerir.

Sınıf I. Bakteroid

Bu sınıf, Bacteroidales adlı tek bir sipariş içerir. Sipariş şu anda beş aileyi içeriyor: Bacteroidaceae, Marinilabiliaceae, Porphyromonadaceae, Prevotellaceae ve Rikenellaceae.

850'den fazla türde temsil edilmektedir. Bu sınıftaki hücreler düz, iğ şeklinde veya ince çubuklar veya gram negatif boyamalı kokobasildir. Spor oluşturmazlar.

Bazıları isteğe bağlı olarak anaerobik olmasına rağmen, bunlar birincil olarak anaerobiktir. Fermantasyon ürünü olarak bütirat üreten basit karbonhidratları fermente ederler, ancak proteinleri ve diğer substratları bozabilirler. Kaydırılarak mobil değildirler veya mobil değildirler.

Sınıf II. Flavobacteria

Flavobacteria sınıfı, Flavobacteriales adı verilen tek bir sipariş içerir. Sipariş şu anda üç aileyi içeriyor: Flavobacteriaceae, Blattabacteriaceae ve Cryomorphaceae. Bu, 3,500'den fazla türü gruplayan filum bacteroidetes'in en büyük sınıfını oluşturur.

Hücreler, spor oluşturmayan, gram negatif, gaz vezikülleri ve hücre içi granülleri olmayan çubuklar veya filamentlerdir. Genellikle ikili bölünme ile çarpılırlar.

Blattabacteriaceae ailesinin üyeleri, böceklerin hücre içi simbiyotlarıdır. Flavobacteriaceae ve Cryomorphaceae familyaları, fermentatif metabolizmaya sahip bazı türler olmasına rağmen, solunum metabolizması olan aerobik veya fakültatif anaerobik kemoorganotrofik bakterilerden oluşur.

Mobil değiller. Bu ailelerin birçok üyesi, büyümek için NaCl veya deniz suyundan tuzlara ihtiyaç duyar.

Flavobacteriaceae familyasının üyeleri, ılıman, tropikal veya kutup bölgelerinde toprakta veya tatlı, acı veya deniz suyunda yaygındır; Cryomorphaceae ailesinin üyeleri ise şimdiye kadar düşük sıcaklıktaki deniz habitatlarıyla sınırlıdır.

Flavobacteriaceae ailesinin bazı üyeleri, insanlar, balıklar veya amfibiler için patojenlerdir.

Sınıf III. Sphingobacteria

Bu sınıf, yalnızca üç aileyi (Sphingobacteriaceae, Chitinophagaceae ve Saprospiraceae), 29 cins ve 787 türü gruplayan Sphingobacteriales sırasını içerir.

Bu sınıftaki bakteriler çubuk şeklindedir. Hareketsizdirler, spor oluşturmazlar ve gram negatif boyamalıdırlar. Aerobik veya fakültatif anaerobik büyüme.

Bazı üyelerde sınırlı fermantasyon kapasitesi ile. Başta Sphingobacterium olmak üzere bazı cinsler, hücresel lipid bileşenleri olarak yüksek konsantrasyonlarda sfingofosfolipid içerir.

Sınıf IV. Cytophagia

Bu sınıf, yalnızca Cytophagales sırasını ve onları bu sınıflandırmaya tam olarak yerleştirememelerini belirtmek için adlandırılmış, incertae sedis sıraları olarak kabul edilen diğer bazı filogenetik grupları içerir.

Bu sınıftaki hücreler kısa veya uzun çubuklar veya filamentler olabilir. Bazı cinsler halkalar, sarmallar veya S-şekilli hücreler oluştururlar Sporocytophaga cinsi dışında spor üretmezler. Kaydırılarak veya hareket ettirilmeyerek hareketlidirler. Flagellalı tek cins Balneola'dır. Gram negatif boyama.

Büyüme genellikle kesinlikle aerobiktir, ancak bazı uzuvlarda mikroaerobik ve anaerobik büyüme meydana gelir. Kemoorganotrofiktirler. Doğada yaygın olarak dağılmışlardır.

Bazı cinsler, büyümeleri için deniz suyu tuzlarına ihtiyaç duyan deniz organizmalarıdır. Türlerin çoğu mezofiliktir ancak psikrofilik ve termofilik üyeler vardır.

Bağırsak mikrobiyotresi

Bakteroidler, insanlarda gastrointestinal sistemin farklı kısımlarını kolonize etmişlerdir. Ayrıca ekinodermler, fareler, köpekler, domuzlar ve geviş getirenler gibi diğer memelilerin mikrobiyotalarında da bulunurlar; tavuklar, hindiler, kazlar ve devekuşları gibi evcil ve yabani kuşlardan; ve kırkayak ve termitler gibi omurgasızlarda.

karşılıkçılık

Çoğu Bacteroidete, konakçılarıyla karşılıklı bir ilişkiye sahiptir. İnsanlarda, T hücresi aracılı yanıtların aktivasyonunu üreten bağışıklık sistemi ile etkileşime girerler ve potansiyel patojenik bakterilerin kolonizasyonunu kontrol ederler.

Bu bakteriler genellikle antineoplastik özelliklere sahip olan ve bu nedenle bağırsak sağlığının korunmasında önemli bir rol oynayan fermantasyonun son ürünü olarak bütirat üretirler.

Safra asidi metabolizması

Ayrıca safra asitlerinin metabolizmasına ve toksik ve / veya mutajenik bileşiklerin dönüşümüne de katılırlar. Memeliler tarafından parçalanması zor olan, sindirim enzimlerinin etkisine dirençli moleküller olan kalın bağırsakta polisakkaritlerin parçalanmasına katkıda bulunurlar.

Bu polisakkaritlerin bakteri aracılı fermantasyonu, konakçı tarafından yeniden emilen uçucu kısa zincirli yağ asitlerinin (esas olarak asetat, propiyonat ve bütirat) salınmasına yol açar. Bu nedenle, bu bağırsak bakterileri, konağın refrakter karbonhidrat kaynaklarından enerji elde etmesine yardımcı olur.

Enerji toplanması

Omnivor memelilerde, özellikle insanlarda, bu ek enerji kaynağı günlük ödeneğin% 7 ila% 10'unu temsil eder.

Sıçanlarda, mikropsuz hayvanların, normal muadillerine göre dışkıda% 87 daha fazla kalori salgıladıkları ve vücut ağırlıklarını korumak için% 30 daha fazla yiyecek yemeleri gerektiği gösterilmiştir.

Bu nedenle, bağırsak mikrobiyotasının varlığı diyetten optimal enerji alımı için gereklidir.

Referanslar

1. Hahnke, RL, J P. Meier-Kolthoff, M García-López, S Mukherjee, M Huntemann, N N. Ivanova, T Woyke, N C. Kyrpides, Hans-Peter, K. ve M. Göker. (2016). Bakteroidlerin Genom Bazlı Taksonomik Sınıflandırması. Frontiers in Microbiology, 7: 2003.
2. Wikipedia'ya katkıda bulunanlar. Bacteroidetes. Wikipedia, Özgür Ansiklopedi, 2017. Es.wikipedia.org adresinde mevcuttur
3. Johnson, EL, Heaver, SL, Walters, WA ve Ley, RE (2017). Mikrobiyom ve metabolik hastalık: Bakteriyel filum Bacteroidetes'i yeniden ziyaret etmek. Moleküler Tıp Dergisi, 95 (1): 1-8.
4. Krieg, NR, J, T. Staley, DR Brown, BP Hedlund, BJ Paster, NL Ward, W. Ludwig ve WB Whitman. (2010) Bergey'in Sistematik Bakteriyoloji El Kitabı: Cilt 4: Bacteroidetes, Spirochaetes, Tenericutes (Mollicutes), Acidobacteria, Fibrobacteres, Fusobacteria, Dictyoglomi, Gemmatimonadetes, Lentisphaerae, Verrucomicrobia, Chlamydiae ve Planctomycetes. KULLANIMLARI.
5. Thomas, F. Hehemann, JH, Rebuffet, E., Czjzek, M. ve Michel, G. 2011. Environmental and Gut Bacteroidetes: The Food Connection. Mikrobiyolojide Sınırlar 2:93.