- Lyase fonksiyonları
- Fosfolipaz C
- Karbonik anhidraz
- enaloz
- Karboksiloz
- Fosfolipaz C
- PEPCK
- Aldolasse
- Alkil cıva liyaz
- Oksalomalat liyaz
- Lyase türleri
- Karbon-karbon liyazları
- Karbon-nitrojen liyazları
- Karbon-kükürt liyazları
- Karbon halojenür liyazları
- Fosfor oksijen liyazları
- Karbon-fosfor liyazlar
- Referanslar
Liyazlar , bir kimyasal bileşikte grupların kesilmesi veya eklenmesinde rol oynayan enzimlerdir. Bu reaksiyonun prensibi, CC, CO veya CN bağlarının kesilmesine dayanır. Sonuç olarak yeni çift bağlar veya halka yapılar oluşur (Mahdi ve Kelly, 2001).
Öte yandan liyazlar, sitrik asit döngüsü gibi hücresel işlemlere ve siyanohidrin üretimi gibi organik senteze katılır.
Poligalakturonik asit liyazın (pektat liyaz) üç boyutlu yapısı. Avrupa Biyoinformatik Enstitüsü Jawahar Swaminathan ve MSD personeli, Wikimedia Commons'tan.
Bu proteinler, belirli özel detaylara sahip oldukları için diğer enzimlerden farklıdır. Tepkimenin bir anlamda, iki alt tabaka üzerinde etki ederlerken, ters yönde sadece bir alt tabakayı etkilerler.
Aslında etkisi, çift bağlı bir yapı oluşturan bir molekülün yok olmasına veya yeni bir halka görünümüne neden olur. Özellikle, pektini parçalayan ve tek birim galakturonik asit, ramnoz ve dekstrin meydana getiren enzim poligalakturonik asit liyaz (pektat liyaz). Ayrıca bazı fitopatojenik mantar ve bakterilerde bulunur.
Lyase fonksiyonları
Liyazlar, gezegenimizin yaşamında pek çok rolü olan ilginç bir enzim grubudur. Bu nedenle, organizmaların yaşamı için önemli süreçlerin kahramanlarıdırlar.
Yani, bu proteinlerin eksikliği, canlıların ölümüne neden olur. Kısacası, bu proteinlerin bilgisi eğlenceli ve şok edicidir. Öte yandan, bizi çevreleyen süreçlerin karmaşıklığını öğretir.
Ek olarak, işlevleri liyazın türüne göre değişir. Sonuç olarak, liyaz aktivitesine sahip çok çeşitli enzimler vardır. Oldukça değişken moleküllerin bağlarını kesebilecek şekilde.
Öte yandan bu proteinlerin bazı örneklerini ve gerçekleştirdikleri görevleri görelim:
Fosfolipaz C
Bu organizmaya bazı böceklerin sindirim sistemini değiştirme yeteneği sağlar. Sonuç olarak, hayvanın vücudunda hızlı çoğalmasını destekler.
Karbonik anhidraz
Karbondioksiti bikarbonata ve protonlara dönüştürür. Su varlığında ise kandaki ve dokulardaki asit-baz dengesinin korunması ve bunlardan karbondioksitin hızla atılması ile ilgilidir.
Ancak bitkilerdeki bu enzim, kloroplasttaki karbondioksit konsantrasyonunu artırarak rubisco enziminin karboksilasyonunu artırır.
Karbonik anhidraz tarafından katalize edilen reaksiyon. GarciaGerry, Wikimedia Commons'tan.
enaloz
Glikolizde 2-fosfogliseratı fosfoenolpiruvata dönüştürür. Bunun yanı sıra glukoneogenezde ters reaksiyon da gerçekleştirebilir. Açıkçası, hücrelerde bu şekerin eksikliği olduğunda glikoz sentezlemeye çalışır.
Bu klasik fonksiyonlara ek olarak enolaz, sinir hücrelerinin aksonlarında bulunur. Aynı zamanda nöronal hasarın ve sinir sistemindeki diğer hasarların bir göstergesidir.
Karboksiloz
Eyleminin bir sonucu olarak karboksil gruplarını pirüvik asitten uzaklaştırır. Sonuç olarak, onu etanol ve karbondioksite dönüştürür.
Mayada, hücrelerdeki CO2'yi yok eder ve etanol üretir. Bu bileşik bir antibiyotik olarak çalışır.
Fosfolipaz C
Tripanozomların zarlarında ve çok çeşitli bakterilerde bulunur. Bu zarlarda bulunan GPI proteinlerinin kesimini oluşturur. Aslında, Trypanosoma brucei'de tespit edilmiştir.
PEPCK
Glukoneojenezde rol oynar, oksaloasetatı fosfoenolpiruvat ve karbondioksite dönüştürür. Öte yandan hayvanlarda karaciğer veya böbrek hücrelerinin diğer metabolitlerden glikoz oluşturmasına izin verir.
Aldolasse
Eylemini glikolizde gösterir; fruktoz-1,6-BF'yi DHAP ve gliseraldehit 3-fosfat olmak üzere iki trioza ayırır. Bu nedenle, çoğu organizmanın sitozolünde bulunan bu enzim, şekerlerden enerji elde edilmesinde önemli bir rol oynar.
Öte yandan kan (veya serum) aldolazının değerlendirilmesi, karaciğer, kas, böbrek veya kalp gibi organlardaki hasarlı yapıların belirlenmesini sağlayan bir araçtır.
Alkil cıva liyaz
Alkan ve cıva iyonları üretmek için etkisini bir alkil-cıva ve hidrojen iyonları substratı üzerinde uygular.
Temel biyolojik rolü, organik cıva bileşiklerini zararlı olmayan ajanlara dönüştürdüğü için toksik eliminasyon mekanizmalarına katılmaktır.
Oksalomalat liyaz
Özellikle 3-oksomalatı iki ürüne dönüştürür: oksoasetat ve glioksilat.
Krebs döngüsünde çalışır, böylece mantarlar, protistler ve bitkiler ortamdan alınan asetatlardan şeker oluşturur.
Lyase türleri
Liyazlar grubu içinde birkaç alt sınıf vardır:
Karbon-karbon liyazları
Bu enzimler karbon-karbon bağlarını keser. Aşağıdaki türlerde sınıflandırılırlar:
- Karboksi liyazlar: COOH ekleyen veya kaldıran. Özellikle, alfa-keto-asit ve beta-keto-asit tipi amino asit gruplarını çıkarırlar.
- CHO-liases: aldol gruplarını ters yönde yoğunlaştırır.
- Okso asit liyazları: kesilmiş asit 3-ROH veya ters reaksiyonlar.
Liasas c arbono-o xigen
Bu enzimler CO bağlarını koparır. Aralarında:
1) Suyu gideren hidroliazlar. Diğer proteinler arasında karbonat veya sitrat de-hidrataz, fumarat hidrataz gibi.
2) Şekerlerden alkolü uzaklaştıran sıvılar. Heparin liyazı, pektat liyazı, glukuronan liyazın yanı sıra birçok başka enzim de bulunur (Albersheim 1962, Courtois 1997).
3) Fosfat substratları üzerinde etkisini gösteren ve fosfatı gideren liazlar.
Karbon-nitrojen liyazları
Açıkçası, karbon-nitrojen bağlarını kesen enzimlerdir. Aşağıdakilere ayrılırlar:
1) Karbon-nitrojen bağlarını kıran ve NH3 oluşturan amonyum liyazlar. Kimin etkisi aspartat, treonin veya histidin üzerindedir.
2) Ek olarak, amidlerde veya amidinlerde CN bağlarını kesen liyazlar vardır. Örneğin, adenilosüksinat liyaz.
3) Amino-liyazlar, amin gruplarında karbon-nitrojen bağlarını keser. Öyle ki, katı sidin sentaz, deasetil ipecoside sentaz, bu enzim grubunda yer alır.
Karbon-kükürt liyazları
Karbon-kükürt bağlarını kesen enzimlerdir. Örneğin, sistein liyaz, laktoilglutatyon liyaz veya metiyonin y-liyaz.
Karbon halojenür liyazları
İlk olarak, bu alt sınıf başlangıçta, hidroklorik asidi (HCl) 1,1,1-trikloro-2,2-bis-etandan (DDT) uzaklaştırmak için enzim temelinde oluşturulmuştur.
Fosfor oksijen liyazları
Fosfolipaz C, bu liyaz kategorisindedir.
Karbon-fosfor liyazlar
Özellikle karbon-fosfor bağları üzerine etki ederler.
Referanslar
- Mehdi, JG, Kelly, DR, 2001. Lyases. İçinde: Rehm, H.-J., Reed, G. (Eds.), Biotechnology Set. Wiley - VCH Verlag GmbH, Weinheim, Almanya, s. 41-171.
- Palomeque P., Martínez M., Valdivia E. ve Maqueda M. (1985). Bacillus laterosporus'un Jaén'deki Ocnogyna baetica larvalarına karşı entomotoksik etkisinin ön çalışmaları. Bull Serv. Vebalar, 11: 147-154.
- Lafrance-Vanasse, J.; Lefebvre, M .; Di Lello, P .; Sygusch, J .; Omichinski, JG (2008). Serbest ve Cıva Bağlı Formlarında Organomercurial Liyaz MerB'nin Kristal Yapıları, metil cıva bozunmasının mekanizmasına ilişkin içgörüler. JBC, 284 (2): 938-944.
- Kondrashov, Fyodor A; Koonin, Eugene V; Morgunov, Igor G; Finogenova, Tatiana V; Kondrashova, Marie N. (2006). Metazoa'da glioksilat döngüsü enzimlerinin evrimi: çoklu yatay transfer olaylarının ve psödogen oluşumunun kanıtı. Biyoloji Direkt, 1:31.
- Albersheim, P. ve Killias, U. (1962). Pektin transeliminazın saflaştırılması ve özellikleri ile ilgili çalışmalar. Arch Biochem. Biophys. 97: 107-115.
- Courtois B, Courtois J (1997). Mutant bir Rhizobium meliloti suşundan glukuronan liyazın tanımlanması. Int J. Biol Macromol. 21 (1-2): 3-9.