- sınıflandırma
- Evrensel
- Misal
- Diferansiyeller
- Misal
- Özel
- Misal
- Biyokimyasal test türleri
- Katalaz testi
- Oksidaz testi
- Tuzlu Mannitol Agar (MSA) Testi
- Koagülaz testi
- Üreaz testi
- Biyokimyasal testler ne içindir?
- Önem
- Referanslar
Biyokimyasal testler mikrobiyoloji mikroorganizmalar belirlemek için, bir örnek içinde mevcut test kimyasalları bir dizi gerçekleştirilmektedir olan bunları ; Bu mikroorganizmalar genellikle bakteridir. Bir mikrobiyologun kullanabileceği çok sayıda biyokimyasal test vardır.
Bununla birlikte, bu testlerin seçimi, bakterilerin belirli bir kategoriye atanmasına izin veren Gram boyama modeli ve büyüme özellikleri gibi ön bulgulara dayanmaktadır. Biyokimyasal testler temel olarak her bir bakteri türünün metabolik özelliklerine dayanır.
Tüm bakteriler aynı özelliklere sahip değildir, bu nedenle substratı ekleyerek ve reaksiyonun oluşmasını bekleyerek belirli bir enzime sahip olup olmadıkları araştırılır. Genellikle bu belirleme, kültür ortamındaki renk veya pH'ta bir değişiklik ile verilir.
Bir bakterinin tür düzeyine kadar güvenilir bir şekilde tanımlanması için genellikle 15'ten az biyokimyasal test gereklidir. Daha fazla biyokimyasal test yapmak, tanımlamaya olan güveni artırabilir.
Bu biyokimyasal testlerin çoğu serum veya kan plazması üzerinde gerçekleştirilir. Bununla birlikte, diğerleri arasında idrar, beyin omurilik sıvısı, plevral sıvı ve dışkı gibi diğer biyolojik salgılar üzerinde de gerçekleştirilebilirler.
sınıflandırma
Biyokimyasal testler 3 grupta sınıflandırılabilir:
Evrensel
Herhangi bir numune üzerinde yapılabilen ve mikrobiyoloğa güvenilir bir tanımlama elde etmek için yapılması gereken aşağıdaki biyokimyasal testlerde rehberlik eden testlerdir.
Misal
Katalaz ve oksidaz testi.
Diferansiyeller
Örnekte bulunan mikroorganizmaları tür düzeyine kadar tanımlamak için yapılan testlerdir.
Bireysel sonuçlar tanımlama yapmak için yeterince bilgilendirici olmadığından, tanımlama bir test kombinasyonunun sonuçlarına göre yapılır.
Misal
IMViC testleri ve şeker kullanım testleri.
Özel
Belirli bir tür kümesi için veya bir türün alt tipini belirlemek için özel testlerdir. Bu testler genellikle alt tür düzeyinde doğrulamak veya tanımlamak için yapılır. Bireysel testler kendi içinde bilgilendiricidir.
Misal
Γ-Glutamil aminopeptidaz testi.
Biyokimyasal test türleri
Katalaz testi
Katalaz testi, hidrojen peroksidi oksijene ve suya parçalayarak katalaz enziminin varlığını göstermeye yönelik bir testtir. Slayt üzerindeki bir damla hidrojen peroksite (% 3) az miktarda bakteri eklenir.
Katalaz testi, mikrobiyologlar tarafından bakteri türlerinin tanımlanmasına yardımcı olmak ve bazı mikropların enzim katalaz üreterek hidrojen peroksiti parçalama yeteneklerini belirlemek için kullanılan basit bir testtir.
Oksijen kabarcıkları gözlenirse, bu, bakterinin katalaz enzimine sahip olduğu anlamına gelir, çünkü hidrojen peroksitin oksijen ve suya ayrışmasını katalize eder. Organizmanın daha sonra katalaz pozitif olduğu söylenir (örneğin, Staphylococcus aureus).
Oksidaz testi
Bu test, sitokrom oksidaz enzimini içeren mikroorganizmaları (elektron taşıma zincirinde önemlidir) tanımlamak için kullanılır. Enterobacteriaceae ve Pseudomadaceae ailelerini ayırt etmek için yaygın olarak kullanılır.
Sitokrom oksidaz, elektronları elektron taşıma zincirinden oksijene (son elektron alıcısı) aktarır ve onu suya indirger. Yapay elektron verici ve alıcı moleküller oksidaz testinde sağlanır.
Elektron vericisi, sitokrom oksidazın etkisiyle oksitlendiğinde, ortam koyu maviye döner ve pozitif bir sonuç olarak kabul edilir. Mikroorganizma Pseudomonas aeruginosa, oksidaz pozitif bir bakteri örneğidir.
Tuzlu Mannitol Agar (MSA) Testi
Bu test türü hem seçici hem de farklıdır. MSA, bu koşullar altında büyümesi engellenen Streptococcus türlerinin aksine, Staphylococcus türleri gibi yüksek tuz konsantrasyonlarına sahip ortamlarda yaşayabilen organizmaları seçecektir.
Bu testteki diferansiyel bileşen mannitol şekeridir. Gıda kaynağı olarak mannitolü kullanabilen organizmalar, asidik olan ve dolayısıyla ortamın pH'ını düşüren fermantasyon yan ürünlerini üretecektir.
Ortamın asitliği, pH indikatörü fenol kırmızısının sararmasına neden olur. Bu yöntemle ayırt edilebilen bakteri türlerinin örnekleri şunlardır: Staphylococcus aureus (mannitolü fermente ettiği için pozitif) ve Staphylococcus epidermidis (mannitolü fermente etmediği için negatif).
Koagülaz testi
Koagülaz, kan plazmasının pıhtılaşmasına yardımcı olan bir enzimdir. Bu test, Staphylococcus aureus'u (koagülaz pozitif) tanımlamak için Gram pozitif ve katalaz pozitif bakteri türleri üzerinde gerçekleştirilir. Aslında koagülaz, bu bakteri türünün virülans faktörüdür.
Bu bakterinin neden olduğu bir enfeksiyon etrafında pıhtı oluşumu muhtemelen onu fagositozdan korur. Staphylococcus aureus'u koagülaz negatif olan diğer Staphylococcus türlerinden ayırmak istediğinizde bu test çok faydalıdır.
Üreaz testi
Bu test, üreaz enzimini kullanarak üreyi hidrolize edebilen bakterileri tanımlamak için kullanılır. Proteus cinsini diğer enterik bakterilerden ayırmak için yaygın olarak kullanılır.
Ürenin hidrolizi, ürünlerinden biri olarak amonyak üretir. Bu zayıf baz, ortamın pH'ını 8.4'ün üzerine çıkarır ve pH göstergesi (fenol kırmızısı) sarıdan pembeye değişir. Üreaz pozitif bakterilere bir örnek, Proteus mirabilis'tir.
Biyokimyasal testler ne içindir?
Mikrobiyolojideki biyokimyasal testler, mikropların neden olduğu hastalıkları teşhis etmek ve bunlarla mücadele için uygulanan tedavileri izlemek için kullanılır. Ek olarak bulaşıcı hastalıkların taranması ve prognozu için kullanılırlar.
Mikroorganizmaların biyokimyasal tanımlanması, bu mikroorganizmaların neler yapabileceğine dair bir fikir sunar, aynı türün farklı türlerinin spesifik biyokimyasal profillerle ayırt edilmesi mümkündür.
Spesifik enzim aktivitelerindeki farklılıklar, mikroorganizmanın ekolojisi, fizyolojisi veya doğal yaşam alanı hakkında bilgi verir ve bu bazı durumlarda önemli bilgiler olarak kabul edilebilir.
Önem
Bakterilerin şeklindeki, boyutundaki ve düzenindeki yapısal farklılıklar tanımlama sürecinde çok az yardımcı olur çünkü şekil, boyut ve düzen bakımından benzer birçok bakteri türü vardır.
Bu nedenle, bakterilerin tanımlanması nihayetinde öncelikle biyokimyasal aktivitelerindeki farklılıklara dayanmaktadır.
Her bakteri türü, diğer tüm türlerden farklı, iyi tanımlanmış bir dizi metabolik aktiviteye sahiptir. Bu biyokimyasal "parmak izleri", bakteriyel enzimler tarafından kontrol edilen özelliklerdir.
Bu nedenle biyokimyasal testler önemlidir çünkü araştırmacının bir numunede bulunan patojenleri doğru bir şekilde tanımlamasına ve böylece hastaya uygun tedaviyi önerebilmesine yardımcı olur.
Referanslar
- Beckett, G., Walker, S. ve Rae, P. (2010). Clinical Biochemistry (8. baskı). Wiley-Blackwell.
- Clarke, PH ve Cowan, ST (1952). Bakteriyoloji için biyokimyasal yöntemler. Genel Mikrobiyoloji Dergisi, 6 (1952), 187-197.
- Gaw, A., Murphy, M., Srivastava, R., Cowan, R., St, D. ve O'Reilly, J. (2013). Clinical Biochemistry (5. baskı). Elsevier Sağlık Bilimleri.
- Goldman, E. & Green, L. (2008). Practical Handbook of Microbiology (2. baskı). CRC Basın.
- Harrigan, W. (1998). Gıda Mikrobiyolojisinde Laboratuvar Yöntemleri (3. baskı). Akademik Basın.
- Vasanthakumari, R. (2009). Pratik Mikrobiyoloji. BI Publications Pvt Ltd.